Detection of Escherichia coli enteropathogens by multiplex polymerase chain reaction from children's diarrheal stools in two Caribbean-Colombian cities.

Acute diarrheal disease is a leading cause of childhood morbidity and mortality in the developing world and Escherichia coli intestinal pathogens are important causative agents. Information on the epidemiology of E. coli intestinal pathogens and their association with diarrheal disease is limited because no diagnostic testing is available in countries with limited resources. To evaluate the prevalence of E. coli intestinal pathogens in a Caribbean-Colombian region, E. coli clinical isolates from children with diarrhea were analyzed by a recently reported two-reaction multiplex polymerase chain reaction (Gomez-Duarte et al., Diagn Microbiol Infect Dis 2009;63:1-9). The phylogenetic group from all E. coli isolates was also typed by a single-reaction multiplex polymerase chain reaction. We found that among 139 E. coli strains analyzed, 20 (14.4%) corresponded to E. coli diarrheagenic pathotypes. Enterotoxigenic, shiga-toxin-producing, enteroaggregative, diffuse adherent, and enteropathogenic E. coli pathotypes were detected, and most of them belonged to the phylogenetic groups A and B1, known to be associated with intestinal pathogens. This is the first report on the molecular characterization of E. coli diarrheogenic isolates in Colombia and the first report on the potential role of E. coli in childhood diarrhea in this geographic area.

Comportamiento de la diarrea causada por virus y bacterias en regiones cercanas a la zona ecuatorial / Behavior of diarrhea caused by viruses and bacterias in regions located near the Equator zone

INTRODUCCIÓN: La enfermedad diarreica aguda (EDA) es un problema de salud a nivel mundial que afecta a la población infantil de distintas regiones. Casi todos los estudios epidemiológicos se han hecho en países con estaciones y poco se informa su comportamiento en países sin estaciones, donde la EDA es endémica con picos epidémicos. OBJETIVOS: Contribuir a conocer la conducta de EDA en Colombia y determinar si su comportamiento es diferente en niños menores de cinco años en dos regiones distintas entre sí en geografía y clima. MATERIALES Y MÉTODOS: Se hizo un estudio descriptivo en dos localidades colombianas. Una en la costa atlántica y otra en el centro del país. La muestra se obtuvo en menores de cinco años que consultaron por diarrea a centros asistenciales de cada región. Los microorganismos bacterianos se identificaron mediante pruebas bioquímicas y los virus con técnicas inmunoenzimáticas. En el análisis estadístico se siguieron un ensayo bivariado y pruebas Z de normalidad para verificar si el clima modifica el comportamiento de EDA y si se presenta de manera distinta en las dos regiones. RESULTADOS: En ambas zonas (Cartagena, Bolívar y Facatativa, Cundinamarca) predominó la diarrea viral, frente a la EDA bacteriana. También en ambas el rotavirus fue prevalente. Fue mucho más baja la presencia de astrovirus y adenovirus. No hubo datos con significación estadística para demostrar que las condiciones ambientales y las propias de los niños, alteran el comportamiento de la EDA, pero sí se observó que la EDA por rotavirus se comporta de manera diferente al analizar en forma comparativa las dos regiones del estudio

G and P genotypes of rotavirus circulating among children with diarrhea in the Colombian northern coast.

A study on the prevalence of rotavirus G and P genotypes was carried out based on 253 stool specimens obtained from children living in the Colombia northern coast region who were less than 3-years-old and who suffered from acute diarrhea. A previous study had detected the presence of rotavirus A in 90 (36.5%) of the 246 samples tested by enzyme immunoassay (EIA), and these strains were investigated in the present study. Of these, 50 strains yielded an RNA electropherotype, most of which (80.0%) had long profiles and 20.0% of which had short profiles. Genotyping of 84 positive samples indicated that 67.9% of the strains could be typed. G1 (57.9%), was the most predominant VP7 genotype, followed by G3 (21.1%), G9 (15.8%) and G2 (5.3%). Among the VP4 genotypes, P[4] (49.1%) was the most prevalent, followed by P[6] 36.4% and P[8] (14.5%). Neither G4 nor G8 nor P[9] types were detected. The most common G-P combinations were G3 P[4] (8.8%) and G9 P[6] (7.0%), followed by G1 P[4] and G1 P[8] (5.3% each). All G1 P[8] strains showed long RNA profiles, whereas G3 P[4] and G9 P[6] displayed both long and short patterns. Mixed infections involved 21.0% of strains. There was a marked diversity among strains collected, and novel strains, including G9, as well as other atypical combinations of G and P genotypes, such as G9 P[6] and G3 P[4], were found.

G and P genotypes of rotavirus circulating among children with diarrhea in the Colombian northern coast / Genotipos G y P de rotavirus encontrados en niños aquejados de diarrea en la costa norte de Colombia

A study on the prevalence of rotavirus G and P genotypes was carried out based on 253 stool specimens obtained from children living in the Colombia northern coast region who were less than 3-years-old and who suffered from acute diarrhea. A previous study had detected the presence of rotavirus A in 90 (36.5%) of the 246 samples tested by enzyme immunoassay (EIA), and these strains were investigated in the present study. Of these, 50 strains yielded an RNA electropherotype, most of which (80.0%) had long profiles and 20.0% of which had short profiles. Genotyping of 84 positive samples indicated that 67.9% of the strains could be typed. G1 (57.9%), was the most predominant VP7 genotype, followed by G3 (21.1%), G9 (15.8%) and G2 (5.3%). Among the VP4 genotypes, P[4] (49.1%) was the most prevalent, followed by P[6] 36.4% and P[8] (14.5%). Neither G4 nor G8 nor P[9] types were detected. The most common G-P combinations were G3 P[4] (8.8%) and G9 P[6] (7.0%), followed by G1 P[4] and G1 P[8] (5.3% each). All G1 P[8] strains showed long RNA profiles, whereas G3 P[4] and G9 P[6] displayed both long and short patterns. Mixed infections involved 21.0% of strains. There was a marked diversity among strains collected, and novel strains, including G9, as well as other atypical combinations of G and P genotypes, such as G9 P[6] and G3 P[4], were found (AU)

El artículo describe un estudio de la prevalencia de los genotipos G y P de rotavirus en 253 muestras fecales de niños menores de 3 años afectados de diarrea aguda que vivían en la costa norte de Colombia. Un estudio anterior reveló la presencia de rotavirus A en 90 (36.5%) de las 246muestras sometidas a inmuno ensayo y dichas muestras fueron las usadas en este estudio. En 50 de las 90 muestras usadas se obtuvo un electroferotipo, un 80.0% de perfil de RNA largo y un 20.0% de perfil de RNA corto. De 84muestras sometidas a genotipificación, se logró tipificar 67.9%. El genotipo G1(57.9%) fue predominante entre los asociados a VP7, seguido de G3(21.1%), G9 (15.8%) y G2 (5.3%). Entre los genotipos VP4, el P[4] (49.1%)fue el de mayor prevalencia, seguido de P[6] 36.4% y de P[8] (14.5%). No se detectaron los genotipos G4, G8 o P[9], y las combinaciones G-P más frecuentes fueron G3 P[4] ( 8.8%) y G9 P[6] (7.0%), seguidas de G1 P[4] y G1P[8], con 5.3% cada una. Todas las cepas G1 P[8] tenían perfil de RNA largo, mientras que G3 P[4] y G9 P[6] los tenían tanto largos como cortos. Se detectaron infecciones mixtas en el 21.0% de las cepas. Se observó una marcada diversidad en las cepas recolectadas y se identificaron cepas nuevas, como G9, y también combinaciones atípicas, como G9 P[6] y G3P[4] (AU)

Rotavirus type A and other enteric pathogens in stool samples from children with acute diarrhea on the Colombian northern coast.

The present study, conducted from March 1998 to July 2000, determined the etiology of acute diarrhea in 253 young children and infants from Cartagena and Sincelejo, Colombia. In 253 stool samples, the following enteric pathogens were recovered: rotavirus type A (36.6%) as the major agent, Salmonella spp (9.0%), Shigella spp (8.0%), enteric pathogenic Escherichia coli (6.0%), enteric hemorragic Esc. coli (2.8%), Providencia alcalifaciens (2.8%), Aeromonas hydrophila (2.0%), Yersinia enterocolitica (0.8%), Entamoeba hystolitica (10%), Giardia lamblia (4%), Endolimax nana (3.2%), Ascaris lumbricoides (2.8%), Ent. coli (1.2%), Balantidium coli (0.8%), Blastocystis hominis (0.8%), Dypilidium caninum (0.4%) and hook worm sp. (0.4%). Infection with more than one pathogen occurred in 96 (37.9%) patients. Rotavirus and enteric pathogenic Esc. coli were frequent. Concurrent infection by more than one parasite occurred in 18.6% of the infants. Most rotavirus infections (76.7%) occurred in infants under 12 months. Vomiting, severe dehydration and fever were frequent in children with rotavirus infection. At least one fecal marker of inflammatory diarrhea was registered in patients with bacterial infection. To our knowledge, this is first report of P. alcalifaciens associated with infantile diarrhea in Colombia and the first description of Esc. coli O157:H7 and Y. enterocolitica in our region.

Rotavirus type A and other enteric pathogens in stool samples from children with acute diarrhea in the Colombian northern coast / Rotavirus de tipo A y otros patógenos entéricos en muestras de heces de niños con diarrea aguda en la costa norte colombiana

The present study, conducted from March 1998 to July 2000, determined the etiology of acute diarrhea in 253 young children and infants from Cartagena and Sincelejo, Colombia. In 253 stool samples, the following enteric pathogens were recovered: rotavirus type A (36.6%) as the major agent, Salmonella spp (9.0%), Shigella spp (8.0%), enteric pathogenic Escherichia coli (6.0%), enteric hemorragic Esc. coli (2.8%), Providencia alcalifaciens (2.8%), Aeromonas hydrophila (2.0%), Yersinia enterocolitica (0.8%), Entamoeba hystolitica (10%), Giardia lamblia (4%), Endolimax nana (3.2%), Ascaris lumbricoides (2.8%), Ent. coli (1.2%), Balantidium coli (0.8%), Blastocystis hominis (0.8%), Dypilidium caninum (0.4%) and hook worm sp. (0.4%). Infection with more than one pathogen occurred in 96 (37.9%) patients. Rotavirus and enteric pathogenic Esc. coli were frequent. Concurrent infection by more than one parasite occurred in 18.6% of the infants. Most rotavirus infections (76.7%) occurred in infants under 12 months. Vomiting, severe dehydration and fever were frequent in children with rotavirus infection. At least one fecal marker of inflammatory diarrhea was registered in patients with bacterial infection. To our knowledge, this is first report of P. alcalifaciens associated with infantile diarrhea in Colombia and the first description of Esc. coli O157:H7 and Y. enterocolitica in our region (AU)

El presente estudio, llevado a cabo entre marzo de 1998 y julio de 2000, determinó la etiología de diarrea aguda en 253 niños y bebés de Cartagena y Sincelejo (Colombia). En 253 muestras de heces se encontraron los siguientes patógenos entéricos: rotavirus de tipo A (36,6 por ciento), que era el patógeno más frecuente, Salmonella spp. (9,0 por ciento), Shigella spp. (8,0 por ciento), Escherichia coli patógena entérica (6,0 por ciento), E. coli hemorrágica entérica (2,8 por ciento), Providencia alcalifaciens (2,8 por ciento), Aeromonas hydrophila (2,0 por ciento), Yersinia enterocolitica (0,8 por ciento), Entamoeba hystolitica (10 por ciento), Giardia lamblia (4 por ciento), Endolimax nana (3,2 por ciento), Ascaris lumbricoides (2,8 por ciento), Entamoeba coli (1,2 por ciento), Balantidium coli (0,8 por ciento), Blastocystis hominis (0,8 por ciento), Dypilidium caninum (0,4 por ciento) y y alguna especie del gusano uncinaria (0,4 por ciento). En 96 pacientes (37,9 por ciento) había infección por más de un patógeno. Los más frecuentes eran rotavirus y E. coli patógena entérica. En un 18,6 por ciento de los niños se daba infección concurrente con más de un parásito. La mayoría de las infecciones por rotavirus (76,7 por ciento) se daban en niños menores de 12 meses. Los síntomas más frecuentes en niños infectados por rotavirus eran vómitos, deshidratación grave y fiebre. Se registró un marcador fecal de diarrea inflamatoria en pacientes con infecciones bacterianas. Según nuestros datos, esta es la primera vez que se encuentra Providencia alcalifaciens asociada a diarrea infantil en Colombia, y la primera descripción de E. coli O157:H7 y Yersinia enterocolitica en nuestra región. (AU)

Cólera en Bolivar de 1991-1997 / Cholera in Bolivar from 1991 until 1997

El cólera, que se ha presentado a través de los siglos en forma endémica y epidémica, continúa siendo un problema de salud pública. Desde 1991, cuando el cólera apareció por primera vez en nuestro país en este siglo, el departamento de Bolívar ha sido uno de los más afectados en la costa atlántica. A partir de entonces, las autoridades de salud del departamento (Dasalud) solicitaron apoyo tecnológico para el diagnóstico microbiológico y capacitación del recurso humano al Laboratorio de Posgrado de Microbiología de la Universidad de Cartagena. Se adelantó este trabajo descriptivo de cooperación interinstitucional con el propósito de analizar el comportamiento del cólera en los municipios de Bolívar. A partir del caso índice, se inició la recolección de muestras en pacientes sospechosos provenientes de las cinco regionales de Dasalud. El diagnóstico de la enfermedad se hizo con base en los criterios clínicos, microbiológicos y epidemiológicos establecidos. Las heces recolectadas en el medio de transporte fueron procesadas para su aislamiento e identificación en medios de cultivo bacteriológicos, bioquímicos y serotipificación con antisueros específicos. De septiembre de 1991 al octavo período de 1997, se informaron 3.470 casos en 38 de 42 municipios y 94,6 por ciento ocurrió en las regionales 1 y 3; 60,2 por ciento correspondió a varones, 39,8 por ciento a mujeres y 79,2 por ciento fueron mayores de 14 años; hubo 33 defunciones; 39,8 por ciento de los casos fue diagnosticado microbiológicamente, con el hallazgo de Vibrio cholerae O1, biotipo El Tor, serotipos Inaba y Ogawa. V. Cholerae O1, serotipo Ogawa, presente en el brote de 1995 desplazó al serotipo Inaba predominante en 1991. En 1991,, el número de casos fue nueve veces mayor que en el brote de 1995 y, en 1997, aumentó 45,2 por ciento con relación a los dos últimos años; la letalidad, a su vez, mostró índices preocupantes a partir de 1992. Los municipios más afectados fueron: Cartagena, Mahates, Montecristo, María la Baja, Pinillos, Achí, Magangue, Arjona, Turbana, Calamar, Mompox, Santa Catalina, Hatillo de Loba, Turbaco, San Martín de Loba, Carmen de Bolívar, Villanueva, Zambrano, Morales, Talaigua Nuevo y Río Viejo, entre otros

Etiología de las meningitis en dos hospitales de Cartagena y su relación con falciformía

En nuestro medio, tanto la meningitis como la falciformía son patologías frecuentes. Con el fin de determinar la etiología bacteriana o micótica en pacientes con diagnóstico clínico de meningitis y observar si existía relación con la falciformía, se estudiaron 142 pacientes de ambos sexos, mayores de un mes, atendidos entre marzo de 1991 y octubre de 1993 en los Hospitales Infantil Napoleón Franco Pareja y Universitario de Cartagena. Se realizaron estudios combinados de laboratorio que incluyeron : coloración de Gram, Ziehl-Neelsen y tinta china, pruebas de aglutinación y determinación de adenosina deaminasa (ADA), estudios citoquímicos rutinarios en el líquido cefalorraquídeo (LCR); hemocultivos y otros exámenes complementarios. Se practicó electroforesis de hemoglobina (HB) en pacientes con meningitis y un grupo control. La etiología bacteriana o micótica de la meningitis se pudo determinar en 93 de los 142 pacientes (65.5 porciento). Los microorganismos más frecuentemente encontrados fueron : Haemophilus influenzae, 37 (39.8 porciento); Neisseria meningitidis, 23 (24.7 porciento); Streptococcus pneumoniae, nueve (9.7 porciento). El resto correspondió a estafilicocos, estreptococos, enterococos y otros bacilos Gram negativos; en dos casos se identificó Mycobacterium tuberculosis y en un paciente VIH positivo se aisló Cryptococcus neoformans. En pacientes con meningitis, se encontró HB S en ocho de 142 (5.6 porciento), en contraste con 12 de 100 (12 porciento) en el grupo control. Los tres principales agentes causantes de meningitis en nuestro estudio fueron H. influenzae, N. meningitidis y S. pneumoniae. No se halló relación entre meningitis y falciformía cuando se compararon los pacientes con el grupo control. Se detectó un caso de meningitis por S. pneumoniae resistente a la penicilina.

Chlamidia trachomatis, Gardnerella vaginalis y otros microorganismos en gestantes del Hospital de Maternidad Rafael Calvo / Chlamydia trachomatis, Gardnerella vaginalis and others microorganisms in pregnancy at the hospital Rafael Calvo

Con el fin de conocer el índice de infección por Chlamydia trachomatis, Gardnerella vaginalis y otros gérmenes sexualmente transmisibles en un grupo de gestantes, se estudiaron 135 mujeres del primer, segundo y tercer trimestre de gestación atendidas en el Hospital de Maternidad Rafael Calvo. Mediante estudios combinados de laboratorio, que incluyeron exámenes directos, cultivos bacteriológicos y técnicas de inmunoensayo, se identificaron los microorganismos infectantes en el flujo vaginal, secreción endocervical y suero de 83 por ciento de los pacientes. Se encontró que el 15,5 por ciento, 9,6 por ciento, 8,5 por ciento, 40 por ciento, 8,8 por ciento y 0,7 por ciento de las gestantes tuvieron infección genital por C. trachomatis, G. vaginalis, T. Vaginalis, Candida sp., Streptococcus B y N. gonorrhoeae, respectivamente; ninguna paciente fue reactiva para marcador de infección activa por citomegalovirus. La cervicitis y el aborto, como antecedentes, fueron las patologías asociadas más frecuentemente halladas; la ruptura temprana de membranas, también se presentó en algunas de las pacientes. La significativa proporción de gestantes con infección por bacteias que causan complicaciones en el embarazo, amerita su estudio en el diagnóstico de rutina de la consulta prenatal del hospital de Maternidad Rafael Calvo